_quarto_TR_pdf.yml

project:
  type: book
  output-dir: _pdf_TR
  resources:
    - "CITATION.cff"
    - images
    - screenshots
    - qrcodes
    - files

execute:
  freeze: auto

lang: tr

language:
  title-block-author-single: "Derleyen"
  title-block-author-plural: "Katkıda Bulunanlar"
  title-block-affiliation-plural: "Kurum"

book:
  title: "Patoloji Atlası"
  subtitle: "Patoloji Atlası: Tıp Fakültesi ve Sağlık Bilimleri Öğrencileri İçin Patoloji Laboratuvar Notları"
  author:
   - name: "Serdar Balcı"
     url: "https://www.serdarbalci.com"
     affiliation: "Memorial Patoloji"
     affiliation-url: "https://patoloji.memorial.com.tr/"
     orcid: "0000-0002-7852-3851"
   - name: Patoloji Hekim ve Teknikerleri
     affiliation: "Memorial Patoloji ve Diğer Kurumlar"
     affiliation-url: "https://www.patolojiatlasi.com/yazarlar.html"
  description: |
    Patoloji Atlası: Tıp Fakültesi ve Sağlık Bilimleri Öğrencileri İçin Patoloji Laboratuvar Notları.
    Patoloji Atlas
    Patoloji Notu
    Sanal Mikroskop 
    Patoloji Ders Notları ve Patoloji Atlası Memorial Patoloji arşivinden derlenen vakalardan ve diğer kurumlardan katkı yapan meslektaşlarımızın kolleksiyonlarından oluşmaktadır.
  abstract: |
    Patoloji Atlası: Tıp Fakültesi ve Sağlık Bilimleri Öğrencileri İçin Patoloji Laboratuvar Notları.

    Patoloji Atlası Memorial Patoloji arşivinden derlenen vakalardan ve diğer kurumlardan katkı yapan meslektaşlarımızın kolleksiyonlarından oluşmaktadır.
    Katkı yapmak ve kendi vakalarınız ekletmek için lütfen [iletişime geçin](https://www.patolojiatlasi.com/katki.html).
  date: last-modified
  image: images/coverTR.png
  output-file: "Patoloji-Atlasi"
  cover-image: images/coverTR.png
  site-url: https://patolojiatlasi.com/
#  repo-url: https://github.com/patolojiatlasi/patolojiatlasi.github.io
  sharing: [twitter, facebook, linkedin]
  search:
    location: navbar
    type: overlay
    copy-button: true
  sidebar:
    style: docked #floating
    background: light
    search: true
    collapsed-level: 1
    pinned: true
  open-graph:
    locale: tr_TR
    site-name: Patoloji Atlası
  twitter-card:
    creator: "%40serdarbalci"
    site: "%40patolojinotlari"
  page-navigation: true
  page-footer:
    border: true
    background: light
    left: "Copyright 2022, [patolojiAI](https://www.patolojiai.com/)"
    # right:
    #   - icon: github
    #     href: https://github.com/patolojiatlasi
    #     target: _blank
    #   - icon: github
    #     href: https://github.com/pathologyatlas
    #     target: _blank
    #   - icon: twitter
    #     href: https://twitter.com/patolojinotlari
    #     target: _blank
    #   - icon: globe2
    #     href: https://www.patolojinotlari.com
    #     target: _blank
    #   - icon: globe2
    #     href: https://www.serdarbalci.com
    #     target: _blank

  chapters:
    - text: "Anasayfa"
      href: index.qmd
    - text: "Giriş"
      href: giris_pdf_TR.qmd
    - part: "Genel Patoloji"
      chapters:
        - text: "Patolojide Kullanılan Teknikler"
          href: teknik_pdf_TR.qmd
        - text: "Hücre İçi Birikimler"
          href: hucre-ici-birikimler_pdf_TR.qmd
        - text: "Hücre Dışı Birikimler"
          href: hucre-disi-birikimler_pdf_TR.qmd
        - text: "Hücre Hasarı"
          href: hucre-hasari_pdf_TR.qmd
        - text: "Hemodinamik Bozukluklar"
#           href: hemodinamik-bozukluklar_pdf_TR.qmd
#         - text: "İskemi ve Nekroz"
          href: iskemi-nekroz_pdf_TR.qmd
        - text: "Konjesyon"
          href: konjesyon_pdf_TR.qmd
        - text: "Amiloid birikimi"
          href: amiloid_pdf_TR.qmd
        - text: "Tamir Mekanizmaları"
          href: tamir_pdf_TR.qmd
        - text: "Erozyon"
          href: erozyon_pdf_TR.qmd
    - part: "İnflamasyon"
      chapters:
        - text: "Akut inflamasyon"
          href: akut-inflamasyon_pdf_TR.qmd
        - text: "Kronik inflamasyon"
          href: kronik-inflamasyon_pdf_TR.qmd
        - text: "Granülamatöz İnflamasyon"
          href: granulom_pdf_TR.qmd
        # - inflamasyon_pdf_TR.qmd
#     - part: "İnfeksiyöz Hastalıkların Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Viruslar"
#           href: virus_pdf_TR.qmd
#         - text: "Bakteriler"
#           href: bakteri_pdf_TR.qmd
#         - text: "Mantarlar"
#           href: mantar_pdf_TR.qmd
#         - text: "Parazitler"
#           href: parazit_pdf_TR.qmd
#     - part: "Temel Tümör Patolojisi"
#       chapters:
#         - benign_pdf_TR.qmd
#         - hamartom_pdf_TR.qmd
#         - heterotopi_pdf_TR.qmd
#         - text: "Metaplazi"
#           href: metaplazi_pdf_TR.qmd
#         - text: "Karsinogenez"
#           href: karsinogenez_pdf_TR.qmd
#         - malign_pdf_TR.qmd
#         - metastaz_pdf_TR.qmd
#         - tumor-yayilimi_pdf_TR.qmd
#     - part: "Tümörlerdeki Prognostik Morfolojik Özellikler"
#       chapters:
#         - text: "Venöz İnvazyon"
#           href: venoz-invazyon_pdf_TR.qmd
#         - text: "Ekstramural Venöz İnvazyon"
#           href: ekstramural-venoz-invazyon_pdf_TR.qmd
#     - part: "Hematopatoloji"
#       chapters:
# #        - hematopatoloji_pdf_TR.qmd
#         - hodgkin_pdf_TR.qmd
#     - part: "Gastrointestinal Sistem Patolojisi"
#       chapters:
#         - gastro_pdf_TR.qmd
#         - text: "Özofagus"
#           href: ozofagus_pdf_TR.qmd
#         - text: "Mide Patolojisi"
#           href: mide_pdf_TR.qmd
#         - text: "Gastrit"
#           href: gastrit_pdf_TR.qmd
#         - text: "Duodenum Patolojisi"
#           href: duodenum_pdf_TR.qmd
#         - text: "Kolon Patolojisi"
#           href: kolon_pdf_TR.qmd
#         - text: "Crohn Hastalığı"
#           href: crohn_pdf_TR.qmd
#     - part: "Karaciğer Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Karaciğer Tümörleri"
#           href: karaciger_pdf_TR.qmd
#         - text: "Benign Karaciğer Tümörleri"
#           href: karaciger-benign_pdf_TR.qmd
#     - part: "Pankreatobilier Sistem Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Pankreas"
#           href: pankreas_pdf_TR.qmd
#         - text: "Pankreas Duktal Adenokarsinom"
#           href: pdac_pdf_TR.qmd
#         - text: "Safra Kesesi"
#           href: safra-kesesi_pdf_TR.qmd
#         - text: "Ampulla Vater"
#           href: ampulla-vater_pdf_TR.qmd
#     - part: "Akciğer Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Nöroendokrin"
#           href: noroendokrin_pdf_TR.qmd
#     - part: "Mezotel"
#       chapters:
#         - text: "Abdomen"
#           href: mezotel_pdf_TR.qmd
#     - part: "Jinekolojik Patoloji"
#       chapters:
#         - text: "Jinekolojik Patoloji"
#           href: jineko_pdf_TR.qmd
#         - text: "Genital Sistem Patolojisi"
#           href: genital_pdf_TR.qmd
#         - text: "Serviks"
#           href: serviks_pdf_TR.qmd
#         - text: "Endometrium"
#           href: endometrium_pdf_TR.qmd
#         - text: "Endometriozis"
#           href: endometriosis_pdf_TR.qmd
#     - part: "Üriner Sistem Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Üropatoloji"
#           href: uriner_pdf_TR.qmd
#         - text: "Böbrek Tümörleri / Renal Tümörler"
#           href: bobrek_pdf_TR.qmd
#         - text: "Prostat"
#           href: prostat_pdf_TR.qmd
#     - part: "Endokrin Sistem Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Hipofiz Adenomu"
#           href: hipofiz_pdf_TR.qmd
#     # - part: "Meme Patolojisi"
#     #   chapters:
#     #     - text: "Meme Tümörleri"
#     #       href: meme_pdf_TR.qmd
#     - part: "Baş Boyun Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Nazofarenks"
#           href: nazofarenks_pdf_TR.qmd
#         - text: "Kulak"
#           href: kulak_pdf_TR.qmd
#         - text: "Tükürük Bezi"
#           href: tukuruk_pdf_TR.qmd
#     - part: "Santral Sinir Sistem Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Gliomlar"
#           href: gliom_pdf_TR.qmd
#         - text: "Meningiom"
#           href: meningiom_pdf_TR.qmd
#         - text: "Vasküler Lezyonlar"
#           href: sss-vaskuler_pdf_TR.qmd
#     - part: "Kemik Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Kemik Tümörleri"
#           href: kemik_pdf_TR.qmd
#     - part: "Yumuşak Doku Patolojisi"
#       chapters:
#         - text: "Adipöz Doku Patolojisi"
#           href: adipoz_pdf_TR.qmd
#     - part: "Pediatrik ve Perinatal Patoloji"
#       chapters:
#         - plasenta_pdf_TR.qmd
#     - part: "Özel Kolleksiyonlar"
#       chapters:
#         - text: "GBDAtlas"
#           href: gbd_pdf_TR.qmd
#         - text: "Hacettepe Ayın Vakası"
#           href: hacettepecom_pdf_TR.qmd
#         - text: "BSAtlas"
#           href: bs_pdf_TR.qmd
#         - text: "ICEtlas"
#           href: ice_pdf_TR.qmd
#         - text: "Benzer Sayfalar"
#           href: wsi_pdf_TR.qmd
#     - referanslar_pdf_TR.qmd
  # appendices:
  #   - text: "Yazarlar ve Katkıda Bulunanlar"
  #     href: yazarlar_pdf_TR.qmd
  #     target: _blank
  #   # - yonetim-gelistirme.qmd
  #   - text: "Katkıda bulunun"
  #     href: katki_pdf_TR.qmd
  #   - text: "Yorum ekleyin"
  #     href: yorum_pdf_TR.qmd
    # - text: "Liste"
    #   href: listing_pdf_TR.qmd
    # - listing2_pdf_TR.qmd


format:
  pdf:
    toc: true
    toc-depth: 2
    # lof: true
    # lot: true
    toc-title: "İçindekiler"
    number-sections: true
    number-depth: 1
    colorlinks: true
    keep-tex: true

    # documentclass: scrbook
    # classoption: [paper=6in:9in,pagesize=pdftex,headinclude=on,footinclude=on,12pt]

    # include-in-header:
    #   text: |
    #     \usepackage{makeidx}
    #     \makeindex

#
      # \usepackage{fvextra}
      # \DefineVerbatimEnvironment{Highlighting}{Verbatim}{breaklines,commandchars=\\\{\}}
      # \areaset[0.50in]{4.5in}{8in}

    # include-before-body:
    #   text: |
    #     \RecustomVerbatimEnvironment{verbatim}{Verbatim}{
    #        showspaces = false,
    #        showtabs = false,
    #        breaksymbolleft={},
    #        breaklines
    #        % Note: setting commandchars=\\\{\} here will cause an error
    #     }
#
#     include-after-body:
#       text: |
#         \printindex
#
#     fig-pos: 'H'

    execute:
      warning: false




# https://www.brodrigues.co/blog/2023-06-29-book_quarto/
# https://github.com/b-rodrigues/kdp_quarto/blob/main/_quarto.yml


# https://quarto.org/docs/reference/formats/pdf.html


citation:
    type: webpage
    container-title: Patoloji Atlası
    url: "https://www.patolojiatlasi.com/"


editor: source